Główny rezerwuar aminokwasów w organizmie to mięśnie. Są one odpowiedzialne za produkcję i uwalnianie do krwioobiegu znacznych ilości alaniny i glutaminy. Powyższe aminokwasy są syntetyzowane przy udziale grup aminowych, które wytwarzane są przez aminokwasy rozgałęzionych lub aminokwasy BCAA. W związku z tym, każdy sportowiec zdaje sobie sprawę jak ważne dla treningu są aminokwasy. W wyniku procesu transaminacji, czyli przeniesienia grupy aminowej na pirogronian powstaje alanina, która uwalniana do krwi trafia do wątroby. W wątrobie zachodzi proces odwrotny - deaminacja aminokwasów, a powstały tutaj pirogronian przekształcany jest w glukozę. Glukoza następnie powraca do mięśni, gdzie znów może zostać wykorzystana do produkcji energii, a caly cykl zatacza kolo. W wyniku procesu deaminacji, uwolniony z alaniny azot zostaje wykorzystany w wątrobie do cyklu mocznikowego i ulega wydaleniu z ustroju, wywolując ujemny bilans azotowy. Same mięśnie przenosząc grupę aminową na pirogronian wykorzystają azot zgromadzony we własnych białkach. Taki cykl przenoszenia azotu między wątrobą a mięśniami nazywa się cyklem alaninowo-glukozowym. Alanina pełni istotna rolę jako przenośnik grup aminowych oraz substratu glukoneogenezy. Mięśnie wychwytują aminokwasy BCAA i przed ich utlenieniem powodują ich deaminację, dzięki czemu grupa aminowa może zostać przeniesiona na pirogronian, nie powodując przy tym uszczerbku w białkach mięśniowych. Aminokwasy BCAA są wychwytywane przez mięśnie. Wątroba nie ma enzymów, które sa w stanie metabolizować aminokwasy BCAA, przez co przechodzą one przez ten narząd i są bezpośrednio wychwytywane przez mięśnie, zarówno w postaci wyizolowanych aminokwasów rozgałęzionych, czy w postaci odżywki.